2022年7月17日,我院2020级本科生蒋济慈负责的大创团队科研成果“Identify Bitter Peptides by Using Deep Representation Learning Features”在《International Journal of Molecular Sciences》在线发表(全文链接:https://www.mdpi.com/1422-0067/23/14/7877)。
苦味是大多数动物和人类趋利避害的信号,蛋白质的苦味往往源自苦味肽的存在。本文基于深度学习预训练神经网络特征提取方法,提出了一种机器学习的苦味肽预测方法iBitter-DRLF。文中使用特征融合及三种序列嵌入技术(SSA、UniRep和BiLSTM),基于机器学习算法以构建多个模型。实验结果表明,深度表示学习的使用大大提高了模型识别苦味肽的能力,实现了仅基于肽序列数据的准确预测。iBitter-DRLF对于改善药物摄入的依从性和推动营养开发有着积极作用,其网络服务器可在线获取。
本文的通讯作者为该大创团队的指导老师bat365在线平台官方网站吕志彬副研究员,第一作者为bat365在线平台官方网站2020级本科生蒋济慈,第二作者为软件工程学院2020级本科生林新旭,第三作者为华西临床医学院2021级本科生姜月琦。该项目得到国家自然科学基金、四川大学中央高校基本科研业务费专项资金和省级大创《基于序列深度表示学习的苦味肽预测》的资助。